Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMPRSS6Q8IU80 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMPRSS6Q8IU80 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMPRSS6Q8IU80 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMPRSS6Q8IU80 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPRSS6Q8IU80 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPRSS6Q8IU80 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPRSS6Q8IU80 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMPRSS6Q8IU80 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPRSS6Q8IU80 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPRSS6Q8IU80 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMPRSS6Q8IU80 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPRSS6Q8IU80 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPRSS6Q8IU80 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPRSS6Q8IU80 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPRSS6Q8IU80 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPRSS6Q8IU80 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms