Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LDLRAD3Q86YD5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD3Q86YD5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD3Q86YD5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRAD3Q86YD5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LDLRAD3Q86YD5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms