Protein–RNA interactions for Protein: Q86W33

TPRA1, Transmembrane protein adipocyte-associated 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRA1Q86W33 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRA1Q86W33 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRA1Q86W33 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRA1Q86W33 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRA1Q86W33 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRA1Q86W33 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRA1Q86W33 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPRA1Q86W33 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPRA1Q86W33 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPRA1Q86W33 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRA1Q86W33 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRA1Q86W33 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPRA1Q86W33 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPRA1Q86W33 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRA1Q86W33 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPRA1Q86W33 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRA1Q86W33 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRA1Q86W33 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRA1Q86W33 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRA1Q86W33 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRA1Q86W33 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRA1Q86W33 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRA1Q86W33 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRA1Q86W33 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRA1Q86W33 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms