Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRTM3Q86VH5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRTM3Q86VH5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRTM3Q86VH5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRTM3Q86VH5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRTM3Q86VH5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRTM3Q86VH5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRTM3Q86VH5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRTM3Q86VH5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRTM3Q86VH5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRTM3Q86VH5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRTM3Q86VH5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRTM3Q86VH5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRTM3Q86VH5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRTM3Q86VH5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRTM3Q86VH5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRTM3Q86VH5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRTM3Q86VH5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRTM3Q86VH5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRTM3Q86VH5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRTM3Q86VH5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRTM3Q86VH5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRTM3Q86VH5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRTM3Q86VH5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRTM3Q86VH5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRTM3Q86VH5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRTM3Q86VH5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRTM3Q86VH5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRTM3Q86VH5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRTM3Q86VH5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRTM3Q86VH5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRTM3Q86VH5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRTM3Q86VH5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRTM3Q86VH5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms