Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B0

CCDC91, Coiled-coil domain-containing protein 91, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC91Q7Z6B0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC91Q7Z6B0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC91Q7Z6B0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC91Q7Z6B0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC91Q7Z6B0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC91Q7Z6B0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms