Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR53Q7Z5U6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR53Q7Z5U6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
WDR53Q7Z5U6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR53Q7Z5U6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR53Q7Z5U6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR53Q7Z5U6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms