Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETXQ7Z333 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETXQ7Z333 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETXQ7Z333 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETXQ7Z333 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETXQ7Z333 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETXQ7Z333 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETXQ7Z333 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETXQ7Z333 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SETXQ7Z333 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETXQ7Z333 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SETXQ7Z333 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SETXQ7Z333 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETXQ7Z333 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETXQ7Z333 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETXQ7Z333 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETXQ7Z333 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETXQ7Z333 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETXQ7Z333 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETXQ7Z333 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETXQ7Z333 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETXQ7Z333 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETXQ7Z333 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETXQ7Z333 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETXQ7Z333 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETXQ7Z333 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETXQ7Z333 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETXQ7Z333 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SETXQ7Z333 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETXQ7Z333 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETXQ7Z333 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETXQ7Z333 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETXQ7Z333 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETXQ7Z333 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETXQ7Z333 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETXQ7Z333 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETXQ7Z333 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SETXQ7Z333 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETXQ7Z333 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETXQ7Z333 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETXQ7Z333 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETXQ7Z333 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETXQ7Z333 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETXQ7Z333 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETXQ7Z333 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETXQ7Z333 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms