Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED13LQ71F56 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED13LQ71F56 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED13LQ71F56 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED13LQ71F56 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED13LQ71F56 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms