Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIAT1Q6ZQX7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIAT1Q6ZQX7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIAT1Q6ZQX7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LIAT1Q6ZQX7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIAT1Q6ZQX7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms