Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC141Q6ZP82 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC141Q6ZP82 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC141Q6ZP82 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC141Q6ZP82 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC141Q6ZP82 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC141Q6ZP82 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CCDC141Q6ZP82 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC141Q6ZP82 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CCDC141Q6ZP82 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CCDC141Q6ZP82 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
CCDC141Q6ZP82 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.03
CCDC141Q6ZP82 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
CCDC141Q6ZP82 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC141Q6ZP82 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CCDC141Q6ZP82 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC141Q6ZP82 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC141Q6ZP82 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC141Q6ZP82 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CCDC141Q6ZP82 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC141Q6ZP82 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
CCDC141Q6ZP82 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC141Q6ZP82 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC141Q6ZP82 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CCDC141Q6ZP82 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CCDC141Q6ZP82 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC141Q6ZP82 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC141Q6ZP82 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CCDC141Q6ZP82 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CCDC141Q6ZP82 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CCDC141Q6ZP82 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
CCDC141Q6ZP82 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CCDC141Q6ZP82 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CCDC141Q6ZP82 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CCDC141Q6ZP82 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CCDC141Q6ZP82 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CCDC141Q6ZP82 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CCDC141Q6ZP82 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CCDC141Q6ZP82 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC141Q6ZP82 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC141Q6ZP82 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC141Q6ZP82 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC141Q6ZP82 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CCDC141Q6ZP82 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CCDC141Q6ZP82 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CCDC141Q6ZP82 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CCDC141Q6ZP82 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC141Q6ZP82 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC141Q6ZP82 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC141Q6ZP82 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC141Q6ZP82 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC141Q6ZP82 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC141Q6ZP82 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC141Q6ZP82 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
CCDC141Q6ZP82 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC141Q6ZP82 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC141Q6ZP82 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC141Q6ZP82 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
CCDC141Q6ZP82 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC141Q6ZP82 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC141Q6ZP82 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CCDC141Q6ZP82 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC141Q6ZP82 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
CCDC141Q6ZP82 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CCDC141Q6ZP82 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC141Q6ZP82 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CCDC141Q6ZP82 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC141Q6ZP82 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC141Q6ZP82 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC141Q6ZP82 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC141Q6ZP82 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms