Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MUC6Q6W4X9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MUC6Q6W4X9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MUC6Q6W4X9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MUC6Q6W4X9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MUC6Q6W4X9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MUC6Q6W4X9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MUC6Q6W4X9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MUC6Q6W4X9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MUC6Q6W4X9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MUC6Q6W4X9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MUC6Q6W4X9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MUC6Q6W4X9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MUC6Q6W4X9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MUC6Q6W4X9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MUC6Q6W4X9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MUC6Q6W4X9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MUC6Q6W4X9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MUC6Q6W4X9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MUC6Q6W4X9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MUC6Q6W4X9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MUC6Q6W4X9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MUC6Q6W4X9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MUC6Q6W4X9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MUC6Q6W4X9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MUC6Q6W4X9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MUC6Q6W4X9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MUC6Q6W4X9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MUC6Q6W4X9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MUC6Q6W4X9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms