Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf88Q6PI97 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C11orf88Q6PI97 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf88Q6PI97 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf88Q6PI97 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms