Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R4Q6NUP7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R4Q6NUP7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R4Q6NUP7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R4Q6NUP7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4R4Q6NUP7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4R4Q6NUP7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP4R4Q6NUP7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R4Q6NUP7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP4R4Q6NUP7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms