Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPRIN2Q6IMN6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPRIN2Q6IMN6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPRIN2Q6IMN6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPRIN2Q6IMN6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms