Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATL3Q6DD88 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATL3Q6DD88 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATL3Q6DD88 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATL3Q6DD88 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATL3Q6DD88 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATL3Q6DD88 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATL3Q6DD88 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATL3Q6DD88 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ATL3Q6DD88 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATL3Q6DD88 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATL3Q6DD88 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATL3Q6DD88 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATL3Q6DD88 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATL3Q6DD88 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATL3Q6DD88 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATL3Q6DD88 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATL3Q6DD88 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATL3Q6DD88 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATL3Q6DD88 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATL3Q6DD88 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ATL3Q6DD88 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATL3Q6DD88 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATL3Q6DD88 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms