Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF43Q68DV7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF43Q68DV7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF43Q68DV7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF43Q68DV7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF43Q68DV7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF43Q68DV7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms