Protein–RNA interactions for Protein: Q63HN8

RNF213, E3 ubiquitin-protein ligase RNF213, humanhuman

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Length 5,207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF213Q63HN8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF213Q63HN8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF213Q63HN8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF213Q63HN8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF213Q63HN8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF213Q63HN8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF213Q63HN8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF213Q63HN8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF213Q63HN8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF213Q63HN8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF213Q63HN8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF213Q63HN8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF213Q63HN8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF213Q63HN8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF213Q63HN8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF213Q63HN8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF213Q63HN8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF213Q63HN8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF213Q63HN8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF213Q63HN8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF213Q63HN8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF213Q63HN8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF213Q63HN8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF213Q63HN8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF213Q63HN8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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