Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPATA1Q5VX52 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPATA1Q5VX52 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPATA1Q5VX52 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPATA1Q5VX52 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPATA1Q5VX52 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPATA1Q5VX52 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPATA1Q5VX52 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPATA1Q5VX52 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPATA1Q5VX52 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPATA1Q5VX52 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPATA1Q5VX52 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPATA1Q5VX52 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
SPATA1Q5VX52 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SPATA1Q5VX52 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPATA1Q5VX52 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPATA1Q5VX52 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPATA1Q5VX52 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPATA1Q5VX52 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPATA1Q5VX52 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPATA1Q5VX52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPATA1Q5VX52 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPATA1Q5VX52 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPATA1Q5VX52 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPATA1Q5VX52 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPATA1Q5VX52 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPATA1Q5VX52 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPATA1Q5VX52 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPATA1Q5VX52 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPATA1Q5VX52 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPATA1Q5VX52 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPATA1Q5VX52 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms