Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TCERG1LQ5VWI1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TCERG1LQ5VWI1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TCERG1LQ5VWI1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCERG1LQ5VWI1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TCERG1LQ5VWI1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TCERG1LQ5VWI1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCERG1LQ5VWI1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms