Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXDC1Q5TGL8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PXDC1Q5TGL8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PXDC1Q5TGL8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PXDC1Q5TGL8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms