Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF19Q5T6S3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF19Q5T6S3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF19Q5T6S3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF19Q5T6S3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF19Q5T6S3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF19Q5T6S3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF19Q5T6S3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms