Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAX1Q5SQQ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VAX1Q5SQQ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAX1Q5SQQ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAX1Q5SQQ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms