Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV6

EXOSC6, Exosome complex component MTR3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC6Q5RKV6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EXOSC6Q5RKV6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC6Q5RKV6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC6Q5RKV6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC6Q5RKV6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC6Q5RKV6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms