Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB41Q5JT25 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB41Q5JT25 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB41Q5JT25 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB41Q5JT25 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB41Q5JT25 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB41Q5JT25 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB41Q5JT25 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB41Q5JT25 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB41Q5JT25 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB41Q5JT25 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB41Q5JT25 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB41Q5JT25 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB41Q5JT25 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB41Q5JT25 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB41Q5JT25 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB41Q5JT25 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB41Q5JT25 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB41Q5JT25 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB41Q5JT25 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB41Q5JT25 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB41Q5JT25 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB41Q5JT25 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB41Q5JT25 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB41Q5JT25 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB41Q5JT25 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB41Q5JT25 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB41Q5JT25 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB41Q5JT25 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB41Q5JT25 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms