Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MS4A13Q5J8X5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MS4A13Q5J8X5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MS4A13Q5J8X5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MS4A13Q5J8X5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MS4A13Q5J8X5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MS4A13Q5J8X5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MS4A13Q5J8X5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MS4A13Q5J8X5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MS4A13Q5J8X5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MS4A13Q5J8X5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MS4A13Q5J8X5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MS4A13Q5J8X5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MS4A13Q5J8X5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MS4A13Q5J8X5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MS4A13Q5J8X5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MS4A13Q5J8X5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MS4A13Q5J8X5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A13Q5J8X5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A13Q5J8X5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A13Q5J8X5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A13Q5J8X5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MS4A13Q5J8X5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A13Q5J8X5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A13Q5J8X5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A13Q5J8X5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MS4A13Q5J8X5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A13Q5J8X5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MS4A13Q5J8X5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A13Q5J8X5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A13Q5J8X5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MS4A13Q5J8X5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A13Q5J8X5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A13Q5J8X5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MS4A13Q5J8X5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A13Q5J8X5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A13Q5J8X5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A13Q5J8X5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms