Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf116Q5BN46 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf116Q5BN46 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf116Q5BN46 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf116Q5BN46 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms