Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNNI3KQ59H18 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNNI3KQ59H18 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNNI3KQ59H18 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TNNI3KQ59H18 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNNI3KQ59H18 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNNI3KQ59H18 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNNI3KQ59H18 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNNI3KQ59H18 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNNI3KQ59H18 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TNNI3KQ59H18 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNNI3KQ59H18 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNNI3KQ59H18 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNNI3KQ59H18 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNNI3KQ59H18 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNNI3KQ59H18 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNNI3KQ59H18 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNNI3KQ59H18 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNNI3KQ59H18 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNNI3KQ59H18 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNNI3KQ59H18 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNNI3KQ59H18 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNNI3KQ59H18 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNNI3KQ59H18 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNNI3KQ59H18 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNNI3KQ59H18 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNNI3KQ59H18 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNNI3KQ59H18 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNNI3KQ59H18 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNNI3KQ59H18 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNNI3KQ59H18 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNNI3KQ59H18 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNNI3KQ59H18 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TNNI3KQ59H18 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNNI3KQ59H18 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNNI3KQ59H18 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNNI3KQ59H18 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNNI3KQ59H18 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNNI3KQ59H18 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNNI3KQ59H18 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNNI3KQ59H18 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNNI3KQ59H18 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNNI3KQ59H18 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNNI3KQ59H18 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNNI3KQ59H18 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNI3KQ59H18 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNI3KQ59H18 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNI3KQ59H18 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms