Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX62

C6orf99, Putative uncharacterized protein C6orf99, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf99Q4VX62 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C6orf99Q4VX62 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf99Q4VX62 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C6orf99Q4VX62 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf99Q4VX62 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf99Q4VX62 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf99Q4VX62 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf99Q4VX62 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf99Q4VX62 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf99Q4VX62 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf99Q4VX62 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf99Q4VX62 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf99Q4VX62 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf99Q4VX62 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms