Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL9Q3SXZ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL9Q3SXZ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTLL9Q3SXZ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL9Q3SXZ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL9Q3SXZ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms