Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNW1

SNAI3, Zinc finger protein SNAI3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3Q3KNW1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAI3Q3KNW1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAI3Q3KNW1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAI3Q3KNW1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAI3Q3KNW1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNAI3Q3KNW1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAI3Q3KNW1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAI3Q3KNW1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms