Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM16LQ309B1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM16LQ309B1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM16LQ309B1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM16LQ309B1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM16LQ309B1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM16LQ309B1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms