Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL38Q2WGJ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KLHL38Q2WGJ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL38Q2WGJ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms