Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRED3Q2MJR0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPRED3Q2MJR0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPRED3Q2MJR0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPRED3Q2MJR0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRED3Q2MJR0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPRED3Q2MJR0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPRED3Q2MJR0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPRED3Q2MJR0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPRED3Q2MJR0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRED3Q2MJR0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPRED3Q2MJR0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPRED3Q2MJR0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPRED3Q2MJR0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPRED3Q2MJR0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPRED3Q2MJR0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPRED3Q2MJR0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPRED3Q2MJR0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPRED3Q2MJR0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPRED3Q2MJR0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms