Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT4

GSG1, Germ cell-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1Q2KHT4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSG1Q2KHT4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSG1Q2KHT4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSG1Q2KHT4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSG1Q2KHT4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms