Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSMPQ1L6U9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSMPQ1L6U9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSMPQ1L6U9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSMPQ1L6U9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSMPQ1L6U9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSMPQ1L6U9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSMPQ1L6U9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
MSMPQ1L6U9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSMPQ1L6U9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSMPQ1L6U9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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