Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD8Q15843 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD8Q15843 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD8Q15843 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD8Q15843 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD8Q15843 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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