Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF1Q15526 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SURF1Q15526 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SURF1Q15526 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SURF1Q15526 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SURF1Q15526 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SURF1Q15526 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SURF1Q15526 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SURF1Q15526 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SURF1Q15526 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SURF1Q15526 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SURF1Q15526 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SURF1Q15526 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SURF1Q15526 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SURF1Q15526 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SURF1Q15526 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SURF1Q15526 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SURF1Q15526 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SURF1Q15526 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SURF1Q15526 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SURF1Q15526 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SURF1Q15526 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SURF1Q15526 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SURF1Q15526 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SURF1Q15526 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SURF1Q15526 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SURF1Q15526 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SURF1Q15526 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SURF1Q15526 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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