Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDK3Q15120 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDK3Q15120 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDK3Q15120 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK3Q15120 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDK3Q15120 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDK3Q15120 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDK3Q15120 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDK3Q15120 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDK3Q15120 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDK3Q15120 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK3Q15120 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK3Q15120 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK3Q15120 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK3Q15120 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK3Q15120 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDK3Q15120 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDK3Q15120 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDK3Q15120 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDK3Q15120 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDK3Q15120 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDK3Q15120 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK3Q15120 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK3Q15120 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK3Q15120 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK3Q15120 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK3Q15120 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK3Q15120 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDK3Q15120 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
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