Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD3Q15059 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD3Q15059 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRD3Q15059 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRD3Q15059 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD3Q15059 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD3Q15059 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRD3Q15059 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD3Q15059 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRD3Q15059 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRD3Q15059 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRD3Q15059 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD3Q15059 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD3Q15059 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD3Q15059 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD3Q15059 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD3Q15059 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD3Q15059 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD3Q15059 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD3Q15059 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD3Q15059 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRD3Q15059 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD3Q15059 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRD3Q15059 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms