Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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