Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN5AQ14524 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCN5AQ14524 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN5AQ14524 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN5AQ14524 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN5AQ14524 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SCN5AQ14524 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms