Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTCH1Q13635 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PTCH1Q13635 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTCH1Q13635 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTCH1Q13635 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTCH1Q13635 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTCH1Q13635 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTCH1Q13635 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTCH1Q13635 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTCH1Q13635 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTCH1Q13635 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTCH1Q13635 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTCH1Q13635 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTCH1Q13635 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTCH1Q13635 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTCH1Q13635 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTCH1Q13635 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTCH1Q13635 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTCH1Q13635 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTCH1Q13635 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTCH1Q13635 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PTCH1Q13635 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTCH1Q13635 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTCH1Q13635 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PTCH1Q13635 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTCH1Q13635 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTCH1Q13635 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTCH1Q13635 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTCH1Q13635 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTCH1Q13635 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
PTCH1Q13635 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PTCH1Q13635 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PTCH1Q13635 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PTCH1Q13635 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PTCH1Q13635 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTCH1Q13635 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PTCH1Q13635 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PTCH1Q13635 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTCH1Q13635 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTCH1Q13635 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTCH1Q13635 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
PTCH1Q13635 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PTCH1Q13635 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTCH1Q13635 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTCH1Q13635 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PTCH1Q13635 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
PTCH1Q13635 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTCH1Q13635 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTCH1Q13635 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
PTCH1Q13635 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTCH1Q13635 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTCH1Q13635 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTCH1Q13635 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTCH1Q13635 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
PTCH1Q13635 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTCH1Q13635 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTCH1Q13635 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTCH1Q13635 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTCH1Q13635 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTCH1Q13635 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTCH1Q13635 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
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