Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms