Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ITGB3BPQ13352 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ITGB3BPQ13352 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB3BPQ13352 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB3BPQ13352 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB3BPQ13352 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGB3BPQ13352 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGB3BPQ13352 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGB3BPQ13352 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGB3BPQ13352 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGB3BPQ13352 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGB3BPQ13352 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGB3BPQ13352 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB3BPQ13352 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB3BPQ13352 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB3BPQ13352 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB3BPQ13352 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB3BPQ13352 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB3BPQ13352 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB3BPQ13352 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB3BPQ13352 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB3BPQ13352 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGB3BPQ13352 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB3BPQ13352 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB3BPQ13352 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB3BPQ13352 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB3BPQ13352 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB3BPQ13352 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB3BPQ13352 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB3BPQ13352 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB3BPQ13352 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB3BPQ13352 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB3BPQ13352 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGB3BPQ13352 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
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