Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTA1Q13330 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTA1Q13330 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTA1Q13330 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTA1Q13330 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTA1Q13330 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTA1Q13330 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTA1Q13330 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MTA1Q13330 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTA1Q13330 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTA1Q13330 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTA1Q13330 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTA1Q13330 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTA1Q13330 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTA1Q13330 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTA1Q13330 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MTA1Q13330 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTA1Q13330 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTA1Q13330 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTA1Q13330 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTA1Q13330 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTA1Q13330 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTA1Q13330 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTA1Q13330 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTA1Q13330 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTA1Q13330 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTA1Q13330 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MTA1Q13330 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTA1Q13330 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTA1Q13330 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTA1Q13330 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTA1Q13330 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTA1Q13330 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MTA1Q13330 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTA1Q13330 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTA1Q13330 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
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