Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTP4A2Q12974 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTP4A2Q12974 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTP4A2Q12974 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTP4A2Q12974 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTP4A2Q12974 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTP4A2Q12974 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTP4A2Q12974 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTP4A2Q12974 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTP4A2Q12974 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTP4A2Q12974 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTP4A2Q12974 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTP4A2Q12974 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTP4A2Q12974 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTP4A2Q12974 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTP4A2Q12974 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTP4A2Q12974 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTP4A2Q12974 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTP4A2Q12974 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTP4A2Q12974 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTP4A2Q12974 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTP4A2Q12974 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTP4A2Q12974 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTP4A2Q12974 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTP4A2Q12974 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTP4A2Q12974 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTP4A2Q12974 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTP4A2Q12974 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTP4A2Q12974 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
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