Protein–RNA interactions for Protein: Q12962

TAF10, Transcription initiation factor TFIID subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF10Q12962 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF10Q12962 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF10Q12962 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF10Q12962 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF10Q12962 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF10Q12962 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF10Q12962 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF10Q12962 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF10Q12962 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF10Q12962 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF10Q12962 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF10Q12962 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF10Q12962 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF10Q12962 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF10Q12962 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF10Q12962 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF10Q12962 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF10Q12962 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF10Q12962 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF10Q12962 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF10Q12962 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF10Q12962 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF10Q12962 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF10Q12962 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
TAF10Q12962 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF10Q12962 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF10Q12962 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF10Q12962 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF10Q12962 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TAF10Q12962 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TAF10Q12962 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF10Q12962 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF10Q12962 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF10Q12962 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF10Q12962 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF10Q12962 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF10Q12962 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF10Q12962 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF10Q12962 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TAF10Q12962 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TAF10Q12962 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF10Q12962 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF10Q12962 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF10Q12962 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF10Q12962 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF10Q12962 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF10Q12962 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF10Q12962 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF10Q12962 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF10Q12962 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF10Q12962 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF10Q12962 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF10Q12962 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF10Q12962 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF10Q12962 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF10Q12962 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF10Q12962 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF10Q12962 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF10Q12962 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF10Q12962 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF10Q12962 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF10Q12962 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF10Q12962 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF10Q12962 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF10Q12962 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF10Q12962 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms