Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TROQ12816 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TROQ12816 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TROQ12816 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TROQ12816 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
TROQ12816 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
TROQ12816 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
TROQ12816 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TROQ12816 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TROQ12816 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TROQ12816 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
TROQ12816 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
TROQ12816 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
TROQ12816 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TROQ12816 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TROQ12816 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TROQ12816 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TROQ12816 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TROQ12816 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TROQ12816 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TROQ12816 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TROQ12816 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TROQ12816 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TROQ12816 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TROQ12816 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TROQ12816 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
TROQ12816 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.26■■■■■ 4.2
TROQ12816 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TROQ12816 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TROQ12816 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TROQ12816 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TROQ12816 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
TROQ12816 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
TROQ12816 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
TROQ12816 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
TROQ12816 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
TROQ12816 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
TROQ12816 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
TROQ12816 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TROQ12816 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TROQ12816 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
TROQ12816 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
TROQ12816 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
TROQ12816 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
TROQ12816 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TROQ12816 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
TROQ12816 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
TROQ12816 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
TROQ12816 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
TROQ12816 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
TROQ12816 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
TROQ12816 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TROQ12816 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
TROQ12816 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TROQ12816 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TROQ12816 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TROQ12816 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TROQ12816 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TROQ12816 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
TROQ12816 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.15
TROQ12816 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TROQ12816 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TROQ12816 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
TROQ12816 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TROQ12816 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TROQ12816 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TROQ12816 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TROQ12816 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
TROQ12816 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TROQ12816 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
TROQ12816 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TROQ12816 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TROQ12816 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
TROQ12816 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
TROQ12816 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TROQ12816 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
TROQ12816 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TROQ12816 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
TROQ12816 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
TROQ12816 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
TROQ12816 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
TROQ12816 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
TROQ12816 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
TROQ12816 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
TROQ12816 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
TROQ12816 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
TROQ12816 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
TROQ12816 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
TROQ12816 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TROQ12816 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TROQ12816 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TROQ12816 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TROQ12816 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TROQ12816 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TROQ12816 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TROQ12816 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TROQ12816 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TROQ12816 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TROQ12816 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
TROQ12816 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
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