Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NCBP1Q09161 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCBP1Q09161 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCBP1Q09161 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCBP1Q09161 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCBP1Q09161 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCBP1Q09161 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCBP1Q09161 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NCBP1Q09161 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCBP1Q09161 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCBP1Q09161 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NCBP1Q09161 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCBP1Q09161 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCBP1Q09161 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCBP1Q09161 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCBP1Q09161 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCBP1Q09161 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCBP1Q09161 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCBP1Q09161 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCBP1Q09161 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms