Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
LRP1Q07954 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1Q07954 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRP1Q07954 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms