Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SOX4Q06945 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOX4Q06945 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOX4Q06945 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOX4Q06945 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOX4Q06945 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX4Q06945 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOX4Q06945 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOX4Q06945 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOX4Q06945 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOX4Q06945 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOX4Q06945 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX4Q06945 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX4Q06945 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX4Q06945 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX4Q06945 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX4Q06945 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX4Q06945 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX4Q06945 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX4Q06945 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX4Q06945 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX4Q06945 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX4Q06945 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX4Q06945 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX4Q06945 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX4Q06945 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX4Q06945 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOX4Q06945 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOX4Q06945 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOX4Q06945 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOX4Q06945 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOX4Q06945 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOX4Q06945 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOX4Q06945 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SOX4Q06945 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOX4Q06945 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOX4Q06945 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOX4Q06945 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOX4Q06945 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOX4Q06945 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOX4Q06945 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOX4Q06945 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOX4Q06945 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOX4Q06945 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOX4Q06945 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOX4Q06945 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOX4Q06945 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOX4Q06945 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SOX4Q06945 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOX4Q06945 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOX4Q06945 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOX4Q06945 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOX4Q06945 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SOX4Q06945 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOX4Q06945 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SOX4Q06945 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SOX4Q06945 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SOX4Q06945 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOX4Q06945 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOX4Q06945 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms